Pandeemia uus etapp: ohtlik tüvi "Delta"

2024 Autor: Seth Attwood | [email protected]. Viimati modifitseeritud: 2023-12-16 16:03

Uus India tüvi covid-19, mille teadlased on juba nimetanud Deltaks, on paljudes riikides tekitanud pandeemia kolmanda laine. New Delhis endas on olukord lihtsalt katastroofiline – 30 000 juhtumit päevas. Instituudid asusid uurima "Deltat" ja andsid kohe häirekella.

Uus tüvi osutus mitte ainult nakkavamaks, vaid ka antikehade suhtes vähem haavatavaks. See tähendab, et ta suudab edukalt seista vastu "vasturünnakutele", mida meie immuunsüsteem tema vastu viib.

Kui 2020. aasta detsembris Indias Maharashtra osariigis esmakordselt ilmus koroonaviiruse variant, mis kannab nüüd nime "Delta", ei paistnud see olevat midagi erilist. Kuid kui see mõni kuu hiljem New Delhisse jõudis, olid tagajärjed kõige laastavamad – aprilli lõpus registreeriti iga päev peaaegu 30 000 juhtumit. "Järsku hakkas ta domineerima ja purustas täielikult alfatüve, mis oli seni linnas kõige levinum," ütleb New Delhi genoomi ja integreeriva bioloogia instituudi juht Anurag Agrawal.

Agrawal ütles, et New Delhis ei esine tõenäoliselt veel üht suurt haiguspuhangut, kuna paljud selle elanikud olid kas haiged või vaktsineeritud. Kuid selgus, et need kaitsevahendid Delta vastu on jõuetud. See on nakkavam ja pääseb immuunsüsteemist välja, ütleb ta: "Kolmemeetrine müür linna ümber tundub olevat muutunud poolemeetriseks, millest pole raske üle astuda."

New Delhist on tüvi kiiresti levinud ja tundub, et nüüd levib üle maakera uus laastav laine. Suurbritannias moodustab Delta juba üle 90% uutest juhtudest: see on põhjustanud koroonaviiruse juhtumite arvu pärast järsku langust taas hüppeliselt ning eelmisel nädalal pidi valitsus isegi piiri avamise plaani viimase etapi edasi lükkama.. Delta puhang Lissabonis sundis Portugali valitsust kehtestama kolmepäevase reisikeelu pealinna ja ülejäänud riigi vahel.

Augusti lõpuks moodustab see võimalus kuni 90% kõigist koroonaviiruse juhtumitest Euroopa Liidus, hoiatas Haiguste Ennetamise ja Tõrje Euroopa Keskuse juht Andrea Ammon täna. "On väga tõenäoline, et Delta tüvi levib suve jooksul laialdaselt, eriti noorte seas, kes ei osale vaktsineerimisprogrammis," ütles ta. "See võib ohustada haavatavamaid kodanikke tõsiselt haigestuda või isegi surra. kui nad ei ole täielikult vaktsineeritud."

Delta võistlusi on registreeritud Venemaal, Indoneesias ja paljudes teistes riikides. USA-s, kus selle tüve levimus on hinnanguliselt vähemalt 14%, teatas CDC 15. juunil, et see on "suurim murekoht".

Tõus on käivitanud hulga uuringuid, et mõista, miks Delta levib palju kiiremini kui ülejäänud kolm murettekitavat varianti, kui see on muidu ohtlikum, ja kuidas selle ainulaadne mutatsioonide kogum, mis põhjustab muutusi valgukeskkonnas, võib põhjustada tõsist kahju. Delta saabumine rõhutas, et SARS-CoV-2 viirus võib lähikuude ja aastate jooksul kohaneda ja areneda.

Praegu kujutab Delta erilist ohtu vaeseimatele riikidele, kelle juurdepääs vaktsiinidele on piiratud või puudub täielikult, ütleb Maailma Terviseorganisatsiooni teaduslik peanõunik Sumya Shwaminathan. "Kõige rohkem teeb mulle muret see, mis juhtub siis, kui Delta Aafrikasse jõuab," ütleb ta.

Inglismaa rahvatervise uuring on toonud esile Delta leviku potentsiaali. Võrreldes 2020. aastal Ühendkuningriigis turule tulnud Alphaga, on meil 50% või 100% rohkem ülekandeid, ütleb Adam Kucharski, Londoni hügieeni ja troopilise meditsiini kooli mudeliarendaja.

Kuid Kuharsky ütleb ka, et vaktsiinikaitse vähenemine võis mõjutada. Inglismaa ja Šotimaa andmete põhjal pakuvad Pfizer-BioNTechi ja AstraZeneca vaktsiinid uue variandi puhul veidi vähem kaitset sümptomaatiliste infektsioonide eest kui Alpha tüve puhul. Inimesed, kellel on vaid üks löök, on eriti haavatavad – nagu ka paljud Ühendkuningriigis. (Kaks vaktsiiniannust tagavad haiglaravi vastu sama kõrge kaitse, isegi Delta vastu.) Kui hästi teised maailmas kasutatavad vaktsiinid kaitsevad, on ebaselge ning varasematest koroonaviiruse lainetest paranenud inimeste kaitse kohta on vähe tõendeid.

Neid mõlemaid efekte – suurenenud ülekandumist ja immuunsuse vältimist – on raske teineteisest eraldada, kuid Wellcome Trusti juht Jeremy Farrar usub, et ülekanne on Delta hüppe, mitte puutumatuse ümbersõidu taga. "Kui Alpha on umbes 50% levivam kui looduslik tüvi ja Delta on veel 50%, siis me räägime viirusest, mis on kaks korda ülekantavam kui algne tüvi," selgitab Oxfordi Aris Katzourakise ülikooli evolutsiooniline viroloog.

See tähendab, et madala vaktsineerimismääraga riigid ja elanikkonnad võivad silmitsi seista suurte uute puhangutega. "Kui kiirem levik on täielikult tingitud viiruse põhjustest, siis on see ülejäänud maailma jaoks katastroofiline uudis," ütleb Kuharski.

Lisaks saadab Delta vaktsineerimata kodanikke suurema tõenäosusega haiglasse kui Alpha. Ühendkuningriigi esialgsed andmed näitavad, et haiglasse sattumise risk võib olla kaks korda suurem. Kokkuvõttes võivad need omadused põhjustada Aafrikas suuri probleeme, ütles Schwaminathan. "Ei tule hapnikku, ei jätku haiglavoodeid. Ja me juba teame, et haiglate tulemused Aafrikas on halvemad kui teistes riikides, ütleb ta. "Seega võib see tõesti kaasa tuua suurema suremuse isegi noorte seas."

Mutatsioonid segavad antikehi

Teadlased on just hakanud välja selgitama, miks Delta on nii ohtlik. Nad keskendusid üheksale mutatsioonile geenis, mis kodeerib pinda sondeerivat piigivalku ja võimaldab viirusel inimese rakkudesse siseneda. Üks oluline mutatsioon, nimega P681R, muudab furiini lõhustamiskoha kõrval olevat aminohapet, kus inimese ensüüm lõhustab valku – see on võtmeetapp, mis võimaldab viirusel inimese rakkudesse siseneda.

Alfa tüves muutis see mutatsioon lõhustamise tõhusamaks. Ühe mai lõpus avaldatud esialgse väljaande kohaselt muudavad Delta mutatsioonid furiini lagunemise veelgi lihtsamaks. Teadlased oletavad, et see võib suurendada ka viiruse edasikanduvust.

Jaapani teadlased, kes lõid sama mutatsiooni kandvaid pseudoviiruseid, ei kinnitanud aga laboritingimustes suurenenud nakkavust ning Indias osutusid sama mutatsiooniga koroonaviiruse teised variandid palju vähem nakkavaks kui Delta, ütleb ülikooli evolutsiooniviroloog. Edinburghist Andrew Rambaut). "Seega peab genoomis olema koostoime millegi muuga."

Teised Delta mutatsioonid võivad aidata immuunsust kahjustada. Mõned neist muudavad lülisamba N-terminaalset domeeni (NTD), mis ulatub valgu pinnast välja. Hiljutises ajakirjas Cell avaldatud artiklis selgus, et üks NTD täppidest, mida nimetatakse "super-saidiks", on alati suunatud taastunud patsientide "ülivõimsate" neutraliseerivate antikehade vastu. Unikaalsed Delta mutatsioonid eemaldavad "ülisageduse" positsioonides 156 ja 157 olevad aminohapped ning muudavad aminohappe 158 arginiinist glütsiiniks - viimane kõrvaldab antikehade sidumise otsese kontaktpunkti, selgitab Florida ülikooli struktuuribioloog David Ostrov.

"Usume, et 157/158 mutatsioon on üks iseloomulikke Delta mutatsioone, mis andsid tüvele selle immuunsusest kõrvalehoidmise fenotüübi," nõustub Fred Hutchinsoni vähiuuringute keskuse arvutibioloog Trevor Bedford.

Teine mutatsioon NTD superpiirkonnas võib samuti võidelda antikehade vastu. Ja teadlased peaksid hakkama uurima muutuste rolli teistes Delta valkudes, ütleb San Francisco California ülikooli molekulaarbioloog Nevan Krogan. "Me ei tea nendest võimalustest igal tasandil palju. Näib, et eksleme pimeduses." Näiteks "Delta" sisaldab mitmeid mutatsioone nukleokapsiidivalgus, mis täidab paljusid funktsioone "nagu Šveitsi armee nuga", selgitab viroloog David Bauer Francis Cricki Instituudist. Selgitamiseks kulub aga kuid katsetamiseks.

Kiirendatud vaktsineerimine

Samal ajal on teadlased ühel meelel: uue variandi leviku peatamiseks on vaja kiiresti tegutseda. "Deltaga seotud mured peaksid motiveerima meid tõesti kiirendama vaktsineerimist ja suurendama vaktsiinide kättesaadavust valdkonnas, kus Delta on üha enam haardejõuline," ütles viroloog Angela Rasmussen Saskatchewani ülikoolist. USA president Joe Biden kutsus ameeriklasi üles tegema täielikku vaktsineerimist, et kaitsta end Delta eest. Ammon kutsus täna Euroopa riike üles kiirendama haavatavate elanikkonnarühmade täieliku vaktsineerimise plaane.

Lisaks on tema sõnul vaja säilitada piirangud, et uus variant ei leviks ega tooks kaasa haigestumuse, haiglaravi ja surmajuhtumite uut tõusu. Riigid, kus juurdepääs vaktsiinidele on piiratud, peavad pöörduma tagasi selliste meetmete juurde nagu füüsiline distantseerimine ja maskid, ütles Rasmussen. Ja Euroopas kutsus Ammon riike üles tegema mõlemat: säilitama piirangud, töötades samal ajal haavatavate elanikkonnarühmade täieliku vaktsineerimise nimel.

Eesmärk ei ole ainult elude päästmine, vaid viiruse edasise arengu ärahoidmine. Delta levik on näidanud, et teadlased ei suuda ohtlikke uusi variante õigel ajal ära tunda, et nende levikut peatada, ütleb Baseli ülikooli viroloog Emma Hodcroft, vaatamata enneolematutele ülemaailmsetele jõupingutustele nende arengut reaalajas jälgida. Oleks ohtlik eeldada, et SARS-CoV-2 peatub seal, ütles Katsurakis. "Kõik evolutsioonis, mis on juhtunud vähemalt kaks korda, on juba muster," ütleb ta. "Ma ei oleks üllatunud, kui järgmise aasta või paari jooksul näeme sarnaseid muutusi."